敦煌站距离敦煌市区4.5公里,位于既有国道和北侧敦煌铁路线路之间的下凹地,南面正对通往莫高窟的公路,为兰州铁路局管辖的车站。
车站建筑面积10865平方米,设有2个站台、8条到发线,接发旅客能力8000人。目前为敦煌铁路尽头站,日均办理旅客列车6列。