泉州站是福厦铁路的主要客运站之一，站房建筑面积2万平方米，站房纵向分为广场层、高架层和站台层三层，建筑总高度近40米，共设4个站台。背靠清源山，普贤路南北走向直接通到火车站门口。站房遵照泉州地方建筑的惯例，如红墙、石柱、石窗、青瓦、曲线屋檐等，具有浓郁的闽南建筑风格。