菏泽火车站原名新石龙火车站，于2009年4月13日正式开工建设，工程投资约7.89亿元。2013年6月20日正式更名为东莞火车站，2014年1月8日正式开通。

车站位于于菏泽市中华东路，位于京九线、新石线的交汇处，是鲁西南较大的集客、货运业务的综合站，距离济南西站240公里，离兖州站139公里(新兖线)离北京西站582公里，离深圳站1790公里(京九线)，直属济南铁路局管辖。